Methylene blue (food grade) beschikt over bacteriedodende en fungicide eigenschappen voor de behandeling van externe bacteriële en schimmelinfecties bij vissen, evenals van sommige huidparasieten – zoals ichthyophthyrus. Toegepast met Aeromonosis, Branchomycosis, Gyrodactylosis, Ichthyophthyriosis, Kostioze, Plistoforose, Saprolegniosis, Hilodonellosis, Tetrahymenosis, Trikhodiniosis, werkt gedeeltelijk op ectoparasites. Het medicijn wordt gebruikt in de vorm van 2 ml 1% oplossing per 10 l water, de behandelingsperiode is maximaal 1 maand. Aan het einde van de behandeling worden actieve koolstoffilters gebruikt om het blauw uit het water van het aquarium te verwijderen.